Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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