Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SIRT1Q96EB6 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SIRT1Q96EB6 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SIRT1Q96EB6 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SIRT1Q96EB6 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SIRT1Q96EB6 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SIRT1Q96EB6 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SIRT1Q96EB6 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SIRT1Q96EB6 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SIRT1Q96EB6 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SIRT1Q96EB6 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SIRT1Q96EB6 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SIRT1Q96EB6 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SIRT1Q96EB6 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SIRT1Q96EB6 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SIRT1Q96EB6 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SIRT1Q96EB6 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SIRT1Q96EB6 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SIRT1Q96EB6 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SIRT1Q96EB6 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SIRT1Q96EB6 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SIRT1Q96EB6 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SIRT1Q96EB6 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SIRT1Q96EB6 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SIRT1Q96EB6 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SIRT1Q96EB6 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SIRT1Q96EB6 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SIRT1Q96EB6 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SIRT1Q96EB6 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SIRT1Q96EB6 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SIRT1Q96EB6 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SIRT1Q96EB6 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
SIRT1Q96EB6 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SIRT1Q96EB6 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SIRT1Q96EB6 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SIRT1Q96EB6 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIRT1Q96EB6 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIRT1Q96EB6 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIRT1Q96EB6 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIRT1Q96EB6 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIRT1Q96EB6 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIRT1Q96EB6 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIRT1Q96EB6 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIRT1Q96EB6 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIRT1Q96EB6 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SIRT1Q96EB6 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIRT1Q96EB6 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SIRT1Q96EB6 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIRT1Q96EB6 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SIRT1Q96EB6 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIRT1Q96EB6 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIRT1Q96EB6 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIRT1Q96EB6 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIRT1Q96EB6 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIRT1Q96EB6 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIRT1Q96EB6 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIRT1Q96EB6 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SIRT1Q96EB6 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIRT1Q96EB6 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIRT1Q96EB6 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIRT1Q96EB6 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIRT1Q96EB6 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIRT1Q96EB6 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIRT1Q96EB6 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIRT1Q96EB6 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SIRT1Q96EB6 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIRT1Q96EB6 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SIRT1Q96EB6 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIRT1Q96EB6 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIRT1Q96EB6 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIRT1Q96EB6 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SIRT1Q96EB6 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIRT1Q96EB6 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIRT1Q96EB6 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIRT1Q96EB6 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SIRT1Q96EB6 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SIRT1Q96EB6 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SIRT1Q96EB6 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SIRT1Q96EB6 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SIRT1Q96EB6 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SIRT1Q96EB6 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SIRT1Q96EB6 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SIRT1Q96EB6 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SIRT1Q96EB6 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SIRT1Q96EB6 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SIRT1Q96EB6 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SIRT1Q96EB6 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SIRT1Q96EB6 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SIRT1Q96EB6 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SIRT1Q96EB6 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SIRT1Q96EB6 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
SIRT1Q96EB6 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SIRT1Q96EB6 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SIRT1Q96EB6 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SIRT1Q96EB6 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
SIRT1Q96EB6 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SIRT1Q96EB6 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SIRT1Q96EB6 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SIRT1Q96EB6 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SIRT1Q96EB6 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms