Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWE3

PRRT3, Proline-rich transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT3Q5FWE3 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRT3Q5FWE3 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms