Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms