Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 275.2 ms