Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC14□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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ZNF239Q16600 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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ZNF239Q16600 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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ZNF239Q16600 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
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ZNF239Q16600 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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