Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPRKQ15262 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
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