Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NCF4Q15080 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NCF4Q15080 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NCF4Q15080 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NCF4Q15080 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NCF4Q15080 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NCF4Q15080 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NCF4Q15080 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NCF4Q15080 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NCF4Q15080 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NCF4Q15080 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NCF4Q15080 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NCF4Q15080 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NCF4Q15080 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NCF4Q15080 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
NCF4Q15080 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NCF4Q15080 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NCF4Q15080 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
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NCF4Q15080 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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NCF4Q15080 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NCF4Q15080 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NCF4Q15080 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NCF4Q15080 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NCF4Q15080 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NCF4Q15080 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NCF4Q15080 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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NCF4Q15080 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NCF4Q15080 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
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NCF4Q15080 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NCF4Q15080 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NCF4Q15080 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.03■□□□□ -0
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NCF4Q15080 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NCF4Q15080 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NCF4Q15080 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NCF4Q15080 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NCF4Q15080 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NCF4Q15080 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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NCF4Q15080 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NCF4Q15080 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NCF4Q15080 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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NCF4Q15080 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NCF4Q15080 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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NCF4Q15080 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NCF4Q15080 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NCF4Q15080 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NCF4Q15080 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NCF4Q15080 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NCF4Q15080 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NCF4Q15080 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NCF4Q15080 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NCF4Q15080 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NCF4Q15080 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
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