Protein–RNA interactions for Protein: Q14134

TRIM29, Tripartite motif-containing protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM29Q14134 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM29Q14134 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms