Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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