Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 AC022762.2-201ENST00000600308 1353 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 KLK13-207ENST00000596955 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 AC027281.2-201ENST00000623856 713 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
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