Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
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STRN3Q13033 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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