Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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