Protein–RNA interactions for Protein: Q12887

COX10, Protoheme IX farnesyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX10Q12887 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
COX10Q12887 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
COX10Q12887 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
COX10Q12887 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
COX10Q12887 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
COX10Q12887 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
COX10Q12887 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
COX10Q12887 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
COX10Q12887 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
COX10Q12887 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
COX10Q12887 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
COX10Q12887 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
COX10Q12887 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
COX10Q12887 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
COX10Q12887 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
COX10Q12887 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
COX10Q12887 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
COX10Q12887 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
COX10Q12887 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
COX10Q12887 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
COX10Q12887 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
COX10Q12887 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
COX10Q12887 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
COX10Q12887 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
COX10Q12887 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
COX10Q12887 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
COX10Q12887 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
COX10Q12887 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
COX10Q12887 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
COX10Q12887 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
COX10Q12887 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
COX10Q12887 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
COX10Q12887 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
COX10Q12887 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
COX10Q12887 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
COX10Q12887 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
COX10Q12887 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
COX10Q12887 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
COX10Q12887 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
COX10Q12887 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
COX10Q12887 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
COX10Q12887 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
COX10Q12887 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
COX10Q12887 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
COX10Q12887 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
COX10Q12887 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
COX10Q12887 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
COX10Q12887 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
COX10Q12887 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
COX10Q12887 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
COX10Q12887 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
COX10Q12887 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
COX10Q12887 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
COX10Q12887 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
COX10Q12887 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
COX10Q12887 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
COX10Q12887 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
COX10Q12887 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
COX10Q12887 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
COX10Q12887 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
COX10Q12887 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
COX10Q12887 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
COX10Q12887 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
COX10Q12887 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
COX10Q12887 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
COX10Q12887 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
COX10Q12887 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
COX10Q12887 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
COX10Q12887 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
COX10Q12887 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
COX10Q12887 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
COX10Q12887 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
COX10Q12887 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
COX10Q12887 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
COX10Q12887 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
COX10Q12887 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
COX10Q12887 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
COX10Q12887 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
COX10Q12887 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
COX10Q12887 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
COX10Q12887 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
COX10Q12887 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
COX10Q12887 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
COX10Q12887 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
COX10Q12887 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
COX10Q12887 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
COX10Q12887 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
COX10Q12887 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
COX10Q12887 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
COX10Q12887 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
COX10Q12887 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
COX10Q12887 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
COX10Q12887 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
COX10Q12887 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
COX10Q12887 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
COX10Q12887 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
COX10Q12887 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
COX10Q12887 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
COX10Q12887 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
COX10Q12887 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 256.9 ms