Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
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KCNMA1Q12791 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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KCNMA1Q12791 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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KCNMA1Q12791 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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KCNMA1Q12791 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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