Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms