Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 AL078595.3-201ENST00000623815 1166 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 JCHAIN-201ENST00000254801 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 AC023590.1-202ENST00000366457 781 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 NXT2-204ENST00000372107 937 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 RPS8-202ENST00000396651 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 AL365214.1-201ENST00000404237 997 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 AL031770.1-201ENST00000430842 851 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 PIH1D2-202ENST00000431456 1245 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 TRIM60P9Y-201ENST00000438459 816 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 TRIM60P11Y-201ENST00000445313 801 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 AC096992.1-201ENST00000459808 709 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 UGT2B29P-201ENST00000509021 973 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 AC092535.2-201ENST00000513176 1204 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 RPL27A-210ENST00000531978 867 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 OR7E2P-201ENST00000533071 889 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 AC006338.2-201ENST00000616864 791 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 AP000487.2-201ENST00000324630 394 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 BPY2-201ENST00000331070 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 BPY2C-201ENST00000382287 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 BPY2B-201ENST00000382392 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 PDCL3P7-201ENST00000392251 712 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 RN7SKP112-201ENST00000411213 318 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 VN1R51P-201ENST00000411675 945 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 TRAV31-201ENST00000502780 342 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 AC084033.1-201ENST00000550830 633 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 ZFAND6-208ENST00000558688 780 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 AC009137.2-201ENST00000568179 641 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms