Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IRF8Q02556 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IRF8Q02556 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IRF8Q02556 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IRF8Q02556 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IRF8Q02556 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IRF8Q02556 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IRF8Q02556 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IRF8Q02556 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IRF8Q02556 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IRF8Q02556 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.08■□□□□ 0
IRF8Q02556 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IRF8Q02556 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.08■□□□□ 0
IRF8Q02556 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
IRF8Q02556 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IRF8Q02556 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IRF8Q02556 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
IRF8Q02556 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.08■□□□□ 0
IRF8Q02556 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IRF8Q02556 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.08■□□□□ 0
IRF8Q02556 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IRF8Q02556 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IRF8Q02556 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IRF8Q02556 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IRF8Q02556 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IRF8Q02556 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IRF8Q02556 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IRF8Q02556 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IRF8Q02556 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IRF8Q02556 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IRF8Q02556 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IRF8Q02556 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IRF8Q02556 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IRF8Q02556 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IRF8Q02556 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IRF8Q02556 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.08■□□□□ 0
IRF8Q02556 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IRF8Q02556 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IRF8Q02556 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRF8Q02556 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRF8Q02556 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRF8Q02556 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IRF8Q02556 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IRF8Q02556 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRF8Q02556 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IRF8Q02556 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRF8Q02556 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRF8Q02556 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRF8Q02556 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRF8Q02556 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IRF8Q02556 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRF8Q02556 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IRF8Q02556 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRF8Q02556 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IRF8Q02556 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
IRF8Q02556 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRF8Q02556 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
IRF8Q02556 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IRF8Q02556 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
IRF8Q02556 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRF8Q02556 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IRF8Q02556 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
IRF8Q02556 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IRF8Q02556 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IRF8Q02556 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRF8Q02556 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IRF8Q02556 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRF8Q02556 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IRF8Q02556 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRF8Q02556 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRF8Q02556 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IRF8Q02556 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRF8Q02556 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRF8Q02556 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IRF8Q02556 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
IRF8Q02556 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IRF8Q02556 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRF8Q02556 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IRF8Q02556 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRF8Q02556 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRF8Q02556 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IRF8Q02556 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRF8Q02556 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRF8Q02556 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRF8Q02556 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IRF8Q02556 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRF8Q02556 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRF8Q02556 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IRF8Q02556 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRF8Q02556 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRF8Q02556 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRF8Q02556 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRF8Q02556 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.06■□□□□ 0
IRF8Q02556 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRF8Q02556 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRF8Q02556 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRF8Q02556 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRF8Q02556 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms