Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MS4A2Q01362 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms