Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms