Protein–RNA interactions for Protein: P63279

UBE2I, SUMO-conjugating enzyme UBC9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2IP63279 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBE2IP63279 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBE2IP63279 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBE2IP63279 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBE2IP63279 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBE2IP63279 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBE2IP63279 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBE2IP63279 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBE2IP63279 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBE2IP63279 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBE2IP63279 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBE2IP63279 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBE2IP63279 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBE2IP63279 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBE2IP63279 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBE2IP63279 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBE2IP63279 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
UBE2IP63279 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
UBE2IP63279 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBE2IP63279 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
UBE2IP63279 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBE2IP63279 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBE2IP63279 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBE2IP63279 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
UBE2IP63279 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBE2IP63279 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBE2IP63279 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBE2IP63279 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
UBE2IP63279 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBE2IP63279 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBE2IP63279 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBE2IP63279 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBE2IP63279 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBE2IP63279 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBE2IP63279 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBE2IP63279 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBE2IP63279 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBE2IP63279 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBE2IP63279 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBE2IP63279 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBE2IP63279 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBE2IP63279 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBE2IP63279 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBE2IP63279 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2IP63279 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2IP63279 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2IP63279 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2IP63279 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2IP63279 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2IP63279 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2IP63279 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2IP63279 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2IP63279 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2IP63279 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2IP63279 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2IP63279 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2IP63279 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2IP63279 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2IP63279 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2IP63279 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2IP63279 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2IP63279 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2IP63279 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2IP63279 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2IP63279 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2IP63279 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2IP63279 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2IP63279 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2IP63279 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2IP63279 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2IP63279 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2IP63279 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2IP63279 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2IP63279 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2IP63279 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2IP63279 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2IP63279 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2IP63279 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2IP63279 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2IP63279 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2IP63279 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2IP63279 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2IP63279 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2IP63279 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2IP63279 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2IP63279 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2IP63279 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2IP63279 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2IP63279 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2IP63279 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2IP63279 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2IP63279 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2IP63279 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2IP63279 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2IP63279 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2IP63279 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2IP63279 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2IP63279 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2IP63279 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2IP63279 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms