Protein–RNA interactions for Protein: P52788

SMS, Spermine synthase, humanhuman

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMSP52788 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMSP52788 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMSP52788 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMSP52788 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMSP52788 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMSP52788 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMSP52788 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMSP52788 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SMSP52788 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMSP52788 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMSP52788 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMSP52788 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMSP52788 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMSP52788 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMSP52788 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMSP52788 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMSP52788 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SMSP52788 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMSP52788 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMSP52788 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMSP52788 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMSP52788 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMSP52788 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SMSP52788 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMSP52788 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMSP52788 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMSP52788 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMSP52788 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SMSP52788 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMSP52788 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SMSP52788 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SMSP52788 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMSP52788 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMSP52788 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMSP52788 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMSP52788 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMSP52788 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMSP52788 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMSP52788 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMSP52788 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMSP52788 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMSP52788 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMSP52788 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMSP52788 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMSP52788 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMSP52788 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMSP52788 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMSP52788 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMSP52788 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMSP52788 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMSP52788 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMSP52788 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SMSP52788 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMSP52788 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMSP52788 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMSP52788 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMSP52788 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMSP52788 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMSP52788 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMSP52788 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMSP52788 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMSP52788 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMSP52788 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMSP52788 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMSP52788 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMSP52788 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMSP52788 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMSP52788 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMSP52788 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMSP52788 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMSP52788 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMSP52788 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SMSP52788 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMSP52788 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMSP52788 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMSP52788 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMSP52788 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMSP52788 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMSP52788 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMSP52788 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMSP52788 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SMSP52788 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMSP52788 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMSP52788 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMSP52788 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMSP52788 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMSP52788 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMSP52788 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMSP52788 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMSP52788 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMSP52788 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMSP52788 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMSP52788 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMSP52788 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMSP52788 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMSP52788 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMSP52788 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMSP52788 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMSP52788 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMSP52788 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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