Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJA4P35212 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJA4P35212 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJA4P35212 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJA4P35212 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GJA4P35212 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJA4P35212 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJA4P35212 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJA4P35212 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJA4P35212 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJA4P35212 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJA4P35212 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJA4P35212 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJA4P35212 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GJA4P35212 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJA4P35212 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJA4P35212 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJA4P35212 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJA4P35212 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJA4P35212 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJA4P35212 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJA4P35212 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJA4P35212 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJA4P35212 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJA4P35212 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJA4P35212 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJA4P35212 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJA4P35212 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJA4P35212 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJA4P35212 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJA4P35212 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJA4P35212 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJA4P35212 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJA4P35212 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJA4P35212 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJA4P35212 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJA4P35212 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJA4P35212 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJA4P35212 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJA4P35212 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJA4P35212 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJA4P35212 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJA4P35212 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJA4P35212 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJA4P35212 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJA4P35212 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJA4P35212 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJA4P35212 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJA4P35212 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJA4P35212 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJA4P35212 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJA4P35212 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJA4P35212 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJA4P35212 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GJA4P35212 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GJA4P35212 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GJA4P35212 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJA4P35212 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GJA4P35212 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GJA4P35212 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJA4P35212 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJA4P35212 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJA4P35212 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJA4P35212 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJA4P35212 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJA4P35212 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJA4P35212 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJA4P35212 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GJA4P35212 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GJA4P35212 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GJA4P35212 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GJA4P35212 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GJA4P35212 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GJA4P35212 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJA4P35212 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJA4P35212 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJA4P35212 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJA4P35212 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJA4P35212 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJA4P35212 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJA4P35212 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJA4P35212 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJA4P35212 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJA4P35212 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GJA4P35212 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJA4P35212 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJA4P35212 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJA4P35212 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJA4P35212 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GJA4P35212 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GJA4P35212 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GJA4P35212 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJA4P35212 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJA4P35212 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJA4P35212 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJA4P35212 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJA4P35212 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJA4P35212 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GJA4P35212 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJA4P35212 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms