Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFNP31947 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFNP31947 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFNP31947 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFNP31947 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFNP31947 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFNP31947 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFNP31947 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFNP31947 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFNP31947 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFNP31947 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFNP31947 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFNP31947 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFNP31947 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFNP31947 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SFNP31947 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFNP31947 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFNP31947 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFNP31947 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFNP31947 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFNP31947 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFNP31947 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFNP31947 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFNP31947 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SFNP31947 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFNP31947 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFNP31947 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFNP31947 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFNP31947 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFNP31947 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFNP31947 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFNP31947 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFNP31947 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFNP31947 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFNP31947 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFNP31947 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFNP31947 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFNP31947 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFNP31947 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFNP31947 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFNP31947 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFNP31947 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFNP31947 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFNP31947 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFNP31947 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFNP31947 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SFNP31947 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFNP31947 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SFNP31947 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFNP31947 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFNP31947 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFNP31947 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SFNP31947 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFNP31947 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFNP31947 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFNP31947 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFNP31947 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SFNP31947 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFNP31947 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFNP31947 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFNP31947 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFNP31947 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFNP31947 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFNP31947 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFNP31947 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFNP31947 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFNP31947 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFNP31947 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFNP31947 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SFNP31947 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFNP31947 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFNP31947 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFNP31947 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFNP31947 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFNP31947 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFNP31947 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFNP31947 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFNP31947 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFNP31947 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFNP31947 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFNP31947 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFNP31947 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFNP31947 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFNP31947 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFNP31947 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFNP31947 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFNP31947 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFNP31947 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFNP31947 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFNP31947 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFNP31947 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFNP31947 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFNP31947 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFNP31947 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFNP31947 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFNP31947 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SFNP31947 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFNP31947 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SFNP31947 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFNP31947 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms