Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms