Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms