Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms