Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 AC022395.1-201ENST00000451610 895 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 AL592161.1-201ENST00000456389 861 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 ZNF720-211ENST00000539915 837 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 AC025040.1-201ENST00000560375 1284 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 AC007216.2-201ENST00000562802 384 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 AC004918.3-201ENST00000602609 925 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 CNOT10-AS1-201ENST00000475395 466 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 IL12A-205ENST00000480787 863 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 OR8K4P-201ENST00000534608 872 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 AL357172.1-201ENST00000556016 593 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 BNIP3P39-201ENST00000601077 554 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 LINC00976-203ENST00000630386 866 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 AC025287.4-201ENST00000640173 1240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms