Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DMDP11532 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DMDP11532 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DMDP11532 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DMDP11532 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DMDP11532 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DMDP11532 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DMDP11532 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
DMDP11532 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
DMDP11532 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DMDP11532 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DMDP11532 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DMDP11532 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DMDP11532 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DMDP11532 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DMDP11532 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DMDP11532 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DMDP11532 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DMDP11532 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DMDP11532 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DMDP11532 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DMDP11532 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
DMDP11532 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
DMDP11532 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
DMDP11532 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DMDP11532 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DMDP11532 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DMDP11532 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DMDP11532 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DMDP11532 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DMDP11532 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DMDP11532 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
DMDP11532 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DMDP11532 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DMDP11532 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DMDP11532 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
DMDP11532 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DMDP11532 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DMDP11532 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DMDP11532 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DMDP11532 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DMDP11532 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DMDP11532 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DMDP11532 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DMDP11532 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DMDP11532 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DMDP11532 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DMDP11532 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DMDP11532 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DMDP11532 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DMDP11532 DUT-207ENST00000559416 635 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DMDP11532 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DMDP11532 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DMDP11532 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DMDP11532 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DMDP11532 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DMDP11532 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DMDP11532 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DMDP11532 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DMDP11532 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DMDP11532 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DMDP11532 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DMDP11532 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DMDP11532 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DMDP11532 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DMDP11532 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
DMDP11532 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
DMDP11532 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DMDP11532 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DMDP11532 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DMDP11532 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DMDP11532 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DMDP11532 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DMDP11532 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
DMDP11532 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DMDP11532 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DMDP11532 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DMDP11532 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
DMDP11532 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
DMDP11532 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
DMDP11532 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DMDP11532 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DMDP11532 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
DMDP11532 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DMDP11532 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
DMDP11532 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DMDP11532 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
DMDP11532 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DMDP11532 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DMDP11532 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
DMDP11532 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
DMDP11532 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
DMDP11532 AC023389.1-201ENST00000577846 576 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
DMDP11532 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DMDP11532 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
DMDP11532 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
DMDP11532 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DMDP11532 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DMDP11532 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
DMDP11532 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms