Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TOP2AP11388 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TOP2AP11388 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TOP2AP11388 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TOP2AP11388 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TOP2AP11388 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TOP2AP11388 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TOP2AP11388 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TOP2AP11388 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TOP2AP11388 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TOP2AP11388 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TOP2AP11388 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TOP2AP11388 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
TOP2AP11388 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TOP2AP11388 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TOP2AP11388 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TOP2AP11388 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TOP2AP11388 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TOP2AP11388 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TOP2AP11388 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TOP2AP11388 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
TOP2AP11388 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TOP2AP11388 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TOP2AP11388 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TOP2AP11388 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TOP2AP11388 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TOP2AP11388 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TOP2AP11388 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TOP2AP11388 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TOP2AP11388 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TOP2AP11388 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TOP2AP11388 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TOP2AP11388 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TOP2AP11388 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TOP2AP11388 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TOP2AP11388 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TOP2AP11388 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TOP2AP11388 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TOP2AP11388 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TOP2AP11388 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TOP2AP11388 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TOP2AP11388 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TOP2AP11388 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TOP2AP11388 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TOP2AP11388 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TOP2AP11388 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TOP2AP11388 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TOP2AP11388 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TOP2AP11388 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TOP2AP11388 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TOP2AP11388 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TOP2AP11388 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TOP2AP11388 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TOP2AP11388 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TOP2AP11388 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TOP2AP11388 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TOP2AP11388 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TOP2AP11388 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TOP2AP11388 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TOP2AP11388 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TOP2AP11388 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TOP2AP11388 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TOP2AP11388 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TOP2AP11388 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TOP2AP11388 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TOP2AP11388 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TOP2AP11388 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TOP2AP11388 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TOP2AP11388 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TOP2AP11388 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TOP2AP11388 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TOP2AP11388 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TOP2AP11388 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TOP2AP11388 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TOP2AP11388 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TOP2AP11388 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TOP2AP11388 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TOP2AP11388 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TOP2AP11388 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TOP2AP11388 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TOP2AP11388 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TOP2AP11388 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TOP2AP11388 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TOP2AP11388 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TOP2AP11388 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TOP2AP11388 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TOP2AP11388 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TOP2AP11388 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TOP2AP11388 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TOP2AP11388 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TOP2AP11388 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TOP2AP11388 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TOP2AP11388 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TOP2AP11388 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TOP2AP11388 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
TOP2AP11388 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TOP2AP11388 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
TOP2AP11388 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
TOP2AP11388 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
TOP2AP11388 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms