Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHGAP10645 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHGAP10645 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHGAP10645 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHGAP10645 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHGAP10645 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHGAP10645 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHGAP10645 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHGAP10645 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHGAP10645 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHGAP10645 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHGAP10645 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CHGAP10645 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHGAP10645 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHGAP10645 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHGAP10645 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHGAP10645 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHGAP10645 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CHGAP10645 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHGAP10645 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CHGAP10645 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHGAP10645 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CHGAP10645 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CHGAP10645 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CHGAP10645 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CHGAP10645 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHGAP10645 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CHGAP10645 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHGAP10645 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHGAP10645 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHGAP10645 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHGAP10645 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHGAP10645 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHGAP10645 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHGAP10645 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CHGAP10645 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHGAP10645 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHGAP10645 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHGAP10645 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHGAP10645 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHGAP10645 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHGAP10645 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHGAP10645 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHGAP10645 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHGAP10645 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHGAP10645 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHGAP10645 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHGAP10645 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHGAP10645 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CHGAP10645 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHGAP10645 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CHGAP10645 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHGAP10645 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CHGAP10645 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHGAP10645 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHGAP10645 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHGAP10645 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHGAP10645 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHGAP10645 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHGAP10645 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHGAP10645 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHGAP10645 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHGAP10645 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHGAP10645 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHGAP10645 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHGAP10645 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHGAP10645 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHGAP10645 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHGAP10645 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHGAP10645 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHGAP10645 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHGAP10645 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHGAP10645 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHGAP10645 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHGAP10645 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHGAP10645 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHGAP10645 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CHGAP10645 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHGAP10645 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHGAP10645 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CHGAP10645 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHGAP10645 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CHGAP10645 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CHGAP10645 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHGAP10645 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CHGAP10645 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHGAP10645 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHGAP10645 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHGAP10645 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHGAP10645 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHGAP10645 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHGAP10645 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHGAP10645 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHGAP10645 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHGAP10645 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHGAP10645 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHGAP10645 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHGAP10645 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHGAP10645 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHGAP10645 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms