Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSLP07711 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSLP07711 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSLP07711 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSLP07711 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSLP07711 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSLP07711 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSLP07711 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSLP07711 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSLP07711 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSLP07711 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSLP07711 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSLP07711 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSLP07711 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSLP07711 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSLP07711 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSLP07711 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSLP07711 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSLP07711 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSLP07711 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSLP07711 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSLP07711 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSLP07711 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSLP07711 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSLP07711 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSLP07711 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSLP07711 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSLP07711 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSLP07711 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSLP07711 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSLP07711 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSLP07711 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSLP07711 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSLP07711 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSLP07711 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSLP07711 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSLP07711 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSLP07711 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSLP07711 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSLP07711 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSLP07711 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSLP07711 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSLP07711 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSLP07711 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSLP07711 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSLP07711 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSLP07711 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSLP07711 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSLP07711 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSLP07711 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSLP07711 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSLP07711 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSLP07711 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSLP07711 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSLP07711 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSLP07711 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSLP07711 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSLP07711 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSLP07711 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSLP07711 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSLP07711 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSLP07711 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSLP07711 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSLP07711 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSLP07711 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSLP07711 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSLP07711 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSLP07711 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSLP07711 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSLP07711 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSLP07711 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSLP07711 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSLP07711 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSLP07711 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSLP07711 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSLP07711 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSLP07711 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSLP07711 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSLP07711 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSLP07711 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSLP07711 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSLP07711 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSLP07711 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSLP07711 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSLP07711 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSLP07711 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSLP07711 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSLP07711 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSLP07711 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSLP07711 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSLP07711 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSLP07711 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSLP07711 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSLP07711 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSLP07711 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSLP07711 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSLP07711 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSLP07711 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSLP07711 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSLP07711 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms