Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms