Protein–RNA interactions for Protein: C9JH25

PRRT4, Proline-rich transmembrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 899 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4C9JH25 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms