Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms