Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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C4orf47A7E2U8 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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C4orf47A7E2U8 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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C4orf47A7E2U8 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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C4orf47A7E2U8 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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