Protein–RNA interactions for Protein: V9GYV3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYV3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
V9GYV3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
V9GYV3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
V9GYV3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
V9GYV3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
V9GYV3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
V9GYV3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
V9GYV3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
V9GYV3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
V9GYV3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
V9GYV3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
V9GYV3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
V9GYV3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
V9GYV3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
V9GYV3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
V9GYV3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
V9GYV3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
V9GYV3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
V9GYV3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
V9GYV3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
V9GYV3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
V9GYV3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
V9GYV3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
V9GYV3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
V9GYV3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
V9GYV3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
V9GYV3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
V9GYV3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
V9GYV3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
V9GYV3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
V9GYV3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
V9GYV3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
V9GYV3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
V9GYV3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
V9GYV3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
V9GYV3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
V9GYV3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
V9GYV3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
V9GYV3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
V9GYV3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
V9GYV3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
V9GYV3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
V9GYV3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
V9GYV3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
V9GYV3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
V9GYV3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
V9GYV3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
V9GYV3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
V9GYV3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
V9GYV3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
V9GYV3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
V9GYV3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
V9GYV3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
V9GYV3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
V9GYV3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
V9GYV3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
V9GYV3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
V9GYV3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
V9GYV3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
V9GYV3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
V9GYV3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
V9GYV3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
V9GYV3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
V9GYV3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
V9GYV3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
V9GYV3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
V9GYV3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
V9GYV3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
V9GYV3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
V9GYV3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
V9GYV3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
V9GYV3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
V9GYV3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
V9GYV3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
V9GYV3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
V9GYV3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
V9GYV3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
V9GYV3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
V9GYV3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
V9GYV3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
V9GYV3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
V9GYV3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
V9GYV3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
V9GYV3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
V9GYV3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
V9GYV3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
V9GYV3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
V9GYV3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
V9GYV3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
V9GYV3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
V9GYV3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
V9GYV3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
V9GYV3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
V9GYV3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
V9GYV3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
V9GYV3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
V9GYV3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
V9GYV3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
V9GYV3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
V9GYV3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms