Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS6

SYNPO2, Synaptopodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2Q9UMS6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYNPO2Q9UMS6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYNPO2Q9UMS6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYNPO2Q9UMS6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYNPO2Q9UMS6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYNPO2Q9UMS6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYNPO2Q9UMS6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYNPO2Q9UMS6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYNPO2Q9UMS6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYNPO2Q9UMS6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYNPO2Q9UMS6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYNPO2Q9UMS6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYNPO2Q9UMS6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYNPO2Q9UMS6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYNPO2Q9UMS6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYNPO2Q9UMS6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYNPO2Q9UMS6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYNPO2Q9UMS6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYNPO2Q9UMS6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYNPO2Q9UMS6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYNPO2Q9UMS6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYNPO2Q9UMS6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYNPO2Q9UMS6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYNPO2Q9UMS6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYNPO2Q9UMS6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYNPO2Q9UMS6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYNPO2Q9UMS6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYNPO2Q9UMS6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYNPO2Q9UMS6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYNPO2Q9UMS6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYNPO2Q9UMS6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYNPO2Q9UMS6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYNPO2Q9UMS6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYNPO2Q9UMS6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYNPO2Q9UMS6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYNPO2Q9UMS6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYNPO2Q9UMS6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYNPO2Q9UMS6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SYNPO2Q9UMS6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SYNPO2Q9UMS6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SYNPO2Q9UMS6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SYNPO2Q9UMS6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SYNPO2Q9UMS6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
SYNPO2Q9UMS6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SYNPO2Q9UMS6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SYNPO2Q9UMS6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SYNPO2Q9UMS6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SYNPO2Q9UMS6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SYNPO2Q9UMS6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SYNPO2Q9UMS6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SYNPO2Q9UMS6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SYNPO2Q9UMS6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SYNPO2Q9UMS6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SYNPO2Q9UMS6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SYNPO2Q9UMS6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SYNPO2Q9UMS6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYNPO2Q9UMS6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYNPO2Q9UMS6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYNPO2Q9UMS6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYNPO2Q9UMS6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYNPO2Q9UMS6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYNPO2Q9UMS6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYNPO2Q9UMS6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYNPO2Q9UMS6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYNPO2Q9UMS6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYNPO2Q9UMS6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYNPO2Q9UMS6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYNPO2Q9UMS6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYNPO2Q9UMS6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SYNPO2Q9UMS6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SYNPO2Q9UMS6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SYNPO2Q9UMS6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SYNPO2Q9UMS6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SYNPO2Q9UMS6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SYNPO2Q9UMS6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SYNPO2Q9UMS6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SYNPO2Q9UMS6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SYNPO2Q9UMS6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SYNPO2Q9UMS6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SYNPO2Q9UMS6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SYNPO2Q9UMS6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SYNPO2Q9UMS6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SYNPO2Q9UMS6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SYNPO2Q9UMS6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYNPO2Q9UMS6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYNPO2Q9UMS6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYNPO2Q9UMS6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYNPO2Q9UMS6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYNPO2Q9UMS6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SYNPO2Q9UMS6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYNPO2Q9UMS6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYNPO2Q9UMS6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYNPO2Q9UMS6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SYNPO2Q9UMS6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYNPO2Q9UMS6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYNPO2Q9UMS6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYNPO2Q9UMS6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYNPO2Q9UMS6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYNPO2Q9UMS6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYNPO2Q9UMS6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms