Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMQ3

BARX2, Homeobox protein BarH-like 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARX2Q9UMQ3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BARX2Q9UMQ3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BARX2Q9UMQ3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BARX2Q9UMQ3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BARX2Q9UMQ3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BARX2Q9UMQ3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BARX2Q9UMQ3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BARX2Q9UMQ3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BARX2Q9UMQ3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BARX2Q9UMQ3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
BARX2Q9UMQ3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BARX2Q9UMQ3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BARX2Q9UMQ3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BARX2Q9UMQ3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BARX2Q9UMQ3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BARX2Q9UMQ3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BARX2Q9UMQ3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BARX2Q9UMQ3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BARX2Q9UMQ3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BARX2Q9UMQ3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BARX2Q9UMQ3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
BARX2Q9UMQ3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BARX2Q9UMQ3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BARX2Q9UMQ3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
BARX2Q9UMQ3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BARX2Q9UMQ3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BARX2Q9UMQ3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BARX2Q9UMQ3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BARX2Q9UMQ3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BARX2Q9UMQ3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BARX2Q9UMQ3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BARX2Q9UMQ3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BARX2Q9UMQ3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BARX2Q9UMQ3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BARX2Q9UMQ3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BARX2Q9UMQ3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BARX2Q9UMQ3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BARX2Q9UMQ3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BARX2Q9UMQ3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BARX2Q9UMQ3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BARX2Q9UMQ3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BARX2Q9UMQ3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BARX2Q9UMQ3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BARX2Q9UMQ3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BARX2Q9UMQ3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BARX2Q9UMQ3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BARX2Q9UMQ3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BARX2Q9UMQ3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BARX2Q9UMQ3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BARX2Q9UMQ3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BARX2Q9UMQ3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BARX2Q9UMQ3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BARX2Q9UMQ3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BARX2Q9UMQ3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BARX2Q9UMQ3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BARX2Q9UMQ3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BARX2Q9UMQ3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BARX2Q9UMQ3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BARX2Q9UMQ3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BARX2Q9UMQ3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BARX2Q9UMQ3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BARX2Q9UMQ3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BARX2Q9UMQ3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BARX2Q9UMQ3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
BARX2Q9UMQ3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BARX2Q9UMQ3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BARX2Q9UMQ3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BARX2Q9UMQ3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BARX2Q9UMQ3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BARX2Q9UMQ3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BARX2Q9UMQ3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BARX2Q9UMQ3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BARX2Q9UMQ3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
BARX2Q9UMQ3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BARX2Q9UMQ3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BARX2Q9UMQ3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BARX2Q9UMQ3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BARX2Q9UMQ3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BARX2Q9UMQ3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BARX2Q9UMQ3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
BARX2Q9UMQ3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BARX2Q9UMQ3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BARX2Q9UMQ3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BARX2Q9UMQ3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BARX2Q9UMQ3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BARX2Q9UMQ3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BARX2Q9UMQ3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BARX2Q9UMQ3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
BARX2Q9UMQ3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BARX2Q9UMQ3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BARX2Q9UMQ3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BARX2Q9UMQ3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BARX2Q9UMQ3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BARX2Q9UMQ3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BARX2Q9UMQ3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BARX2Q9UMQ3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BARX2Q9UMQ3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BARX2Q9UMQ3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BARX2Q9UMQ3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BARX2Q9UMQ3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128 ms