Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL19

RARRES3, Retinoic acid receptor responder protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES3Q9UL19 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RARRES3Q9UL19 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RARRES3Q9UL19 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RARRES3Q9UL19 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RARRES3Q9UL19 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RARRES3Q9UL19 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RARRES3Q9UL19 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RARRES3Q9UL19 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RARRES3Q9UL19 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RARRES3Q9UL19 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RARRES3Q9UL19 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RARRES3Q9UL19 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RARRES3Q9UL19 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RARRES3Q9UL19 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RARRES3Q9UL19 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RARRES3Q9UL19 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RARRES3Q9UL19 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RARRES3Q9UL19 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RARRES3Q9UL19 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RARRES3Q9UL19 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RARRES3Q9UL19 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RARRES3Q9UL19 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RARRES3Q9UL19 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RARRES3Q9UL19 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RARRES3Q9UL19 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RARRES3Q9UL19 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RARRES3Q9UL19 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RARRES3Q9UL19 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RARRES3Q9UL19 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RARRES3Q9UL19 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RARRES3Q9UL19 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RARRES3Q9UL19 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RARRES3Q9UL19 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RARRES3Q9UL19 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RARRES3Q9UL19 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RARRES3Q9UL19 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RARRES3Q9UL19 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RARRES3Q9UL19 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RARRES3Q9UL19 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RARRES3Q9UL19 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RARRES3Q9UL19 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RARRES3Q9UL19 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RARRES3Q9UL19 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RARRES3Q9UL19 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RARRES3Q9UL19 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RARRES3Q9UL19 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RARRES3Q9UL19 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RARRES3Q9UL19 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RARRES3Q9UL19 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RARRES3Q9UL19 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RARRES3Q9UL19 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RARRES3Q9UL19 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RARRES3Q9UL19 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RARRES3Q9UL19 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RARRES3Q9UL19 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RARRES3Q9UL19 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RARRES3Q9UL19 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RARRES3Q9UL19 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RARRES3Q9UL19 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RARRES3Q9UL19 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RARRES3Q9UL19 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RARRES3Q9UL19 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RARRES3Q9UL19 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RARRES3Q9UL19 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RARRES3Q9UL19 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RARRES3Q9UL19 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RARRES3Q9UL19 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RARRES3Q9UL19 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RARRES3Q9UL19 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RARRES3Q9UL19 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RARRES3Q9UL19 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RARRES3Q9UL19 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RARRES3Q9UL19 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RARRES3Q9UL19 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RARRES3Q9UL19 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RARRES3Q9UL19 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RARRES3Q9UL19 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RARRES3Q9UL19 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RARRES3Q9UL19 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RARRES3Q9UL19 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RARRES3Q9UL19 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RARRES3Q9UL19 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RARRES3Q9UL19 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RARRES3Q9UL19 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RARRES3Q9UL19 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RARRES3Q9UL19 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RARRES3Q9UL19 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RARRES3Q9UL19 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RARRES3Q9UL19 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RARRES3Q9UL19 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RARRES3Q9UL19 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RARRES3Q9UL19 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RARRES3Q9UL19 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RARRES3Q9UL19 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RARRES3Q9UL19 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RARRES3Q9UL19 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RARRES3Q9UL19 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RARRES3Q9UL19 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RARRES3Q9UL19 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RARRES3Q9UL19 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms