Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NKX1-2Q9UD57 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NKX1-2Q9UD57 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NKX1-2Q9UD57 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NKX1-2Q9UD57 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NKX1-2Q9UD57 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NKX1-2Q9UD57 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NKX1-2Q9UD57 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NKX1-2Q9UD57 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NKX1-2Q9UD57 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NKX1-2Q9UD57 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NKX1-2Q9UD57 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NKX1-2Q9UD57 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NKX1-2Q9UD57 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NKX1-2Q9UD57 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NKX1-2Q9UD57 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NKX1-2Q9UD57 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NKX1-2Q9UD57 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NKX1-2Q9UD57 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NKX1-2Q9UD57 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NKX1-2Q9UD57 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NKX1-2Q9UD57 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NKX1-2Q9UD57 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NKX1-2Q9UD57 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NKX1-2Q9UD57 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NKX1-2Q9UD57 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NKX1-2Q9UD57 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NKX1-2Q9UD57 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NKX1-2Q9UD57 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NKX1-2Q9UD57 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NKX1-2Q9UD57 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NKX1-2Q9UD57 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NKX1-2Q9UD57 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NKX1-2Q9UD57 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NKX1-2Q9UD57 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NKX1-2Q9UD57 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NKX1-2Q9UD57 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NKX1-2Q9UD57 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NKX1-2Q9UD57 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NKX1-2Q9UD57 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NKX1-2Q9UD57 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NKX1-2Q9UD57 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NKX1-2Q9UD57 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NKX1-2Q9UD57 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NKX1-2Q9UD57 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NKX1-2Q9UD57 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NKX1-2Q9UD57 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NKX1-2Q9UD57 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NKX1-2Q9UD57 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NKX1-2Q9UD57 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NKX1-2Q9UD57 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NKX1-2Q9UD57 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NKX1-2Q9UD57 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NKX1-2Q9UD57 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NKX1-2Q9UD57 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NKX1-2Q9UD57 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NKX1-2Q9UD57 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NKX1-2Q9UD57 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NKX1-2Q9UD57 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NKX1-2Q9UD57 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NKX1-2Q9UD57 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NKX1-2Q9UD57 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NKX1-2Q9UD57 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NKX1-2Q9UD57 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NKX1-2Q9UD57 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NKX1-2Q9UD57 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NKX1-2Q9UD57 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NKX1-2Q9UD57 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NKX1-2Q9UD57 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NKX1-2Q9UD57 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NKX1-2Q9UD57 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NKX1-2Q9UD57 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NKX1-2Q9UD57 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NKX1-2Q9UD57 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NKX1-2Q9UD57 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NKX1-2Q9UD57 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NKX1-2Q9UD57 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NKX1-2Q9UD57 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NKX1-2Q9UD57 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NKX1-2Q9UD57 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NKX1-2Q9UD57 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NKX1-2Q9UD57 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NKX1-2Q9UD57 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NKX1-2Q9UD57 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NKX1-2Q9UD57 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NKX1-2Q9UD57 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NKX1-2Q9UD57 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NKX1-2Q9UD57 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NKX1-2Q9UD57 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NKX1-2Q9UD57 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NKX1-2Q9UD57 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NKX1-2Q9UD57 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NKX1-2Q9UD57 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NKX1-2Q9UD57 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NKX1-2Q9UD57 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NKX1-2Q9UD57 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NKX1-2Q9UD57 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NKX1-2Q9UD57 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NKX1-2Q9UD57 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NKX1-2Q9UD57 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms