Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU7

DBF4, Protein DBF4 homolog A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 674 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBF4Q9UBU7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
DBF4Q9UBU7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
DBF4Q9UBU7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
DBF4Q9UBU7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
DBF4Q9UBU7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
DBF4Q9UBU7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
DBF4Q9UBU7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
DBF4Q9UBU7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
DBF4Q9UBU7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
DBF4Q9UBU7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
DBF4Q9UBU7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
DBF4Q9UBU7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
DBF4Q9UBU7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
DBF4Q9UBU7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
DBF4Q9UBU7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
DBF4Q9UBU7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
DBF4Q9UBU7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
DBF4Q9UBU7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
DBF4Q9UBU7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
DBF4Q9UBU7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
DBF4Q9UBU7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
DBF4Q9UBU7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
DBF4Q9UBU7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
DBF4Q9UBU7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
DBF4Q9UBU7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
DBF4Q9UBU7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
DBF4Q9UBU7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
DBF4Q9UBU7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
DBF4Q9UBU7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
DBF4Q9UBU7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
DBF4Q9UBU7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
DBF4Q9UBU7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
DBF4Q9UBU7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
DBF4Q9UBU7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
DBF4Q9UBU7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
DBF4Q9UBU7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
DBF4Q9UBU7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
DBF4Q9UBU7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
DBF4Q9UBU7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
DBF4Q9UBU7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
DBF4Q9UBU7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
DBF4Q9UBU7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
DBF4Q9UBU7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
DBF4Q9UBU7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
DBF4Q9UBU7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
DBF4Q9UBU7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC29.62■■■□□ 2.33
DBF4Q9UBU7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
DBF4Q9UBU7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
DBF4Q9UBU7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
DBF4Q9UBU7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
DBF4Q9UBU7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
DBF4Q9UBU7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
DBF4Q9UBU7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
DBF4Q9UBU7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
DBF4Q9UBU7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
DBF4Q9UBU7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
DBF4Q9UBU7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
DBF4Q9UBU7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
DBF4Q9UBU7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
DBF4Q9UBU7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
DBF4Q9UBU7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
DBF4Q9UBU7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
DBF4Q9UBU7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
DBF4Q9UBU7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
DBF4Q9UBU7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
DBF4Q9UBU7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
DBF4Q9UBU7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
DBF4Q9UBU7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
DBF4Q9UBU7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
DBF4Q9UBU7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
DBF4Q9UBU7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
DBF4Q9UBU7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
DBF4Q9UBU7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
DBF4Q9UBU7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
DBF4Q9UBU7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
DBF4Q9UBU7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
DBF4Q9UBU7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
DBF4Q9UBU7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
DBF4Q9UBU7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
DBF4Q9UBU7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
DBF4Q9UBU7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
DBF4Q9UBU7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
DBF4Q9UBU7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
DBF4Q9UBU7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
DBF4Q9UBU7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
DBF4Q9UBU7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
DBF4Q9UBU7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
DBF4Q9UBU7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
DBF4Q9UBU7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
DBF4Q9UBU7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
DBF4Q9UBU7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
DBF4Q9UBU7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
DBF4Q9UBU7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
DBF4Q9UBU7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
DBF4Q9UBU7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
DBF4Q9UBU7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
DBF4Q9UBU7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
DBF4Q9UBU7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
DBF4Q9UBU7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
DBF4Q9UBU7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms