Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
POLKQ9UBT6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
POLKQ9UBT6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
POLKQ9UBT6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
POLKQ9UBT6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
POLKQ9UBT6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
POLKQ9UBT6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
POLKQ9UBT6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
POLKQ9UBT6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
POLKQ9UBT6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
POLKQ9UBT6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
POLKQ9UBT6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
POLKQ9UBT6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
POLKQ9UBT6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
POLKQ9UBT6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
POLKQ9UBT6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
POLKQ9UBT6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
POLKQ9UBT6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
POLKQ9UBT6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
POLKQ9UBT6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
POLKQ9UBT6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
POLKQ9UBT6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
POLKQ9UBT6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
POLKQ9UBT6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
POLKQ9UBT6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
POLKQ9UBT6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
POLKQ9UBT6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
POLKQ9UBT6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
POLKQ9UBT6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
POLKQ9UBT6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
POLKQ9UBT6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
POLKQ9UBT6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
POLKQ9UBT6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
POLKQ9UBT6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
POLKQ9UBT6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
POLKQ9UBT6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
POLKQ9UBT6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
POLKQ9UBT6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
POLKQ9UBT6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
POLKQ9UBT6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
POLKQ9UBT6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
POLKQ9UBT6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
POLKQ9UBT6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC31.26■■■□□ 2.59
POLKQ9UBT6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
POLKQ9UBT6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
POLKQ9UBT6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
POLKQ9UBT6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
POLKQ9UBT6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
POLKQ9UBT6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
POLKQ9UBT6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
POLKQ9UBT6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
POLKQ9UBT6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
POLKQ9UBT6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
POLKQ9UBT6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
POLKQ9UBT6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
POLKQ9UBT6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
POLKQ9UBT6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
POLKQ9UBT6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
POLKQ9UBT6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
POLKQ9UBT6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
POLKQ9UBT6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
POLKQ9UBT6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
POLKQ9UBT6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC31.23■■■□□ 2.59
POLKQ9UBT6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
POLKQ9UBT6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
POLKQ9UBT6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
POLKQ9UBT6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
POLKQ9UBT6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
POLKQ9UBT6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
POLKQ9UBT6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
POLKQ9UBT6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
POLKQ9UBT6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
POLKQ9UBT6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
POLKQ9UBT6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
POLKQ9UBT6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
POLKQ9UBT6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
POLKQ9UBT6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
POLKQ9UBT6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
POLKQ9UBT6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
POLKQ9UBT6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
POLKQ9UBT6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
POLKQ9UBT6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
POLKQ9UBT6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC31.18■■■□□ 2.58
POLKQ9UBT6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
POLKQ9UBT6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
POLKQ9UBT6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
POLKQ9UBT6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
POLKQ9UBT6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
POLKQ9UBT6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
POLKQ9UBT6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
POLKQ9UBT6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
POLKQ9UBT6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
POLKQ9UBT6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
POLKQ9UBT6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
POLKQ9UBT6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
POLKQ9UBT6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
POLKQ9UBT6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
POLKQ9UBT6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
POLKQ9UBT6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
POLKQ9UBT6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms