Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBS3

DNAJB9, DnaJ homolog subfamily B member 9, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB9Q9UBS3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DNAJB9Q9UBS3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DNAJB9Q9UBS3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DNAJB9Q9UBS3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DNAJB9Q9UBS3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DNAJB9Q9UBS3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DNAJB9Q9UBS3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DNAJB9Q9UBS3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DNAJB9Q9UBS3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DNAJB9Q9UBS3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DNAJB9Q9UBS3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DNAJB9Q9UBS3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DNAJB9Q9UBS3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DNAJB9Q9UBS3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DNAJB9Q9UBS3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DNAJB9Q9UBS3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DNAJB9Q9UBS3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DNAJB9Q9UBS3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DNAJB9Q9UBS3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DNAJB9Q9UBS3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DNAJB9Q9UBS3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DNAJB9Q9UBS3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DNAJB9Q9UBS3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DNAJB9Q9UBS3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DNAJB9Q9UBS3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DNAJB9Q9UBS3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DNAJB9Q9UBS3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DNAJB9Q9UBS3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DNAJB9Q9UBS3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DNAJB9Q9UBS3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DNAJB9Q9UBS3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
DNAJB9Q9UBS3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DNAJB9Q9UBS3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DNAJB9Q9UBS3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DNAJB9Q9UBS3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DNAJB9Q9UBS3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
DNAJB9Q9UBS3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DNAJB9Q9UBS3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DNAJB9Q9UBS3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DNAJB9Q9UBS3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DNAJB9Q9UBS3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DNAJB9Q9UBS3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DNAJB9Q9UBS3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DNAJB9Q9UBS3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DNAJB9Q9UBS3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DNAJB9Q9UBS3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
DNAJB9Q9UBS3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DNAJB9Q9UBS3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DNAJB9Q9UBS3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DNAJB9Q9UBS3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DNAJB9Q9UBS3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DNAJB9Q9UBS3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DNAJB9Q9UBS3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DNAJB9Q9UBS3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DNAJB9Q9UBS3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DNAJB9Q9UBS3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DNAJB9Q9UBS3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAJB9Q9UBS3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAJB9Q9UBS3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAJB9Q9UBS3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAJB9Q9UBS3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAJB9Q9UBS3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAJB9Q9UBS3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAJB9Q9UBS3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAJB9Q9UBS3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAJB9Q9UBS3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAJB9Q9UBS3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAJB9Q9UBS3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAJB9Q9UBS3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAJB9Q9UBS3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAJB9Q9UBS3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAJB9Q9UBS3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAJB9Q9UBS3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAJB9Q9UBS3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAJB9Q9UBS3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAJB9Q9UBS3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAJB9Q9UBS3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAJB9Q9UBS3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAJB9Q9UBS3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAJB9Q9UBS3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAJB9Q9UBS3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAJB9Q9UBS3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAJB9Q9UBS3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAJB9Q9UBS3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAJB9Q9UBS3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAJB9Q9UBS3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAJB9Q9UBS3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAJB9Q9UBS3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAJB9Q9UBS3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAJB9Q9UBS3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAJB9Q9UBS3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAJB9Q9UBS3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAJB9Q9UBS3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAJB9Q9UBS3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAJB9Q9UBS3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAJB9Q9UBS3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAJB9Q9UBS3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAJB9Q9UBS3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAJB9Q9UBS3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAJB9Q9UBS3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms