Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NKIRAS1Q9NYS0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NKIRAS1Q9NYS0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NKIRAS1Q9NYS0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NKIRAS1Q9NYS0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NKIRAS1Q9NYS0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NKIRAS1Q9NYS0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NKIRAS1Q9NYS0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NKIRAS1Q9NYS0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NKIRAS1Q9NYS0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NKIRAS1Q9NYS0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NKIRAS1Q9NYS0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NKIRAS1Q9NYS0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NKIRAS1Q9NYS0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NKIRAS1Q9NYS0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NKIRAS1Q9NYS0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NKIRAS1Q9NYS0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NKIRAS1Q9NYS0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NKIRAS1Q9NYS0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NKIRAS1Q9NYS0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NKIRAS1Q9NYS0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NKIRAS1Q9NYS0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NKIRAS1Q9NYS0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NKIRAS1Q9NYS0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NKIRAS1Q9NYS0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NKIRAS1Q9NYS0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NKIRAS1Q9NYS0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NKIRAS1Q9NYS0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NKIRAS1Q9NYS0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NKIRAS1Q9NYS0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NKIRAS1Q9NYS0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NKIRAS1Q9NYS0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NKIRAS1Q9NYS0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NKIRAS1Q9NYS0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NKIRAS1Q9NYS0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NKIRAS1Q9NYS0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NKIRAS1Q9NYS0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NKIRAS1Q9NYS0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NKIRAS1Q9NYS0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NKIRAS1Q9NYS0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NKIRAS1Q9NYS0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NKIRAS1Q9NYS0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NKIRAS1Q9NYS0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NKIRAS1Q9NYS0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NKIRAS1Q9NYS0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NKIRAS1Q9NYS0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
NKIRAS1Q9NYS0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
NKIRAS1Q9NYS0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NKIRAS1Q9NYS0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NKIRAS1Q9NYS0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NKIRAS1Q9NYS0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NKIRAS1Q9NYS0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NKIRAS1Q9NYS0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NKIRAS1Q9NYS0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NKIRAS1Q9NYS0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NKIRAS1Q9NYS0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NKIRAS1Q9NYS0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NKIRAS1Q9NYS0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NKIRAS1Q9NYS0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NKIRAS1Q9NYS0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NKIRAS1Q9NYS0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NKIRAS1Q9NYS0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NKIRAS1Q9NYS0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NKIRAS1Q9NYS0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NKIRAS1Q9NYS0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NKIRAS1Q9NYS0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NKIRAS1Q9NYS0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NKIRAS1Q9NYS0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NKIRAS1Q9NYS0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NKIRAS1Q9NYS0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NKIRAS1Q9NYS0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NKIRAS1Q9NYS0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NKIRAS1Q9NYS0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NKIRAS1Q9NYS0 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NKIRAS1Q9NYS0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NKIRAS1Q9NYS0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NKIRAS1Q9NYS0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NKIRAS1Q9NYS0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NKIRAS1Q9NYS0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NKIRAS1Q9NYS0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NKIRAS1Q9NYS0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NKIRAS1Q9NYS0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NKIRAS1Q9NYS0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NKIRAS1Q9NYS0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NKIRAS1Q9NYS0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NKIRAS1Q9NYS0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NKIRAS1Q9NYS0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NKIRAS1Q9NYS0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NKIRAS1Q9NYS0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NKIRAS1Q9NYS0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NKIRAS1Q9NYS0 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NKIRAS1Q9NYS0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NKIRAS1Q9NYS0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NKIRAS1Q9NYS0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NKIRAS1Q9NYS0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NKIRAS1Q9NYS0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NKIRAS1Q9NYS0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NKIRAS1Q9NYS0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NKIRAS1Q9NYS0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms