Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUJ3

TCP11L1, T-complex protein 11-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP11L1Q9NUJ3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TCP11L1Q9NUJ3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TCP11L1Q9NUJ3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TCP11L1Q9NUJ3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TCP11L1Q9NUJ3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TCP11L1Q9NUJ3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TCP11L1Q9NUJ3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TCP11L1Q9NUJ3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TCP11L1Q9NUJ3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TCP11L1Q9NUJ3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TCP11L1Q9NUJ3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TCP11L1Q9NUJ3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TCP11L1Q9NUJ3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TCP11L1Q9NUJ3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TCP11L1Q9NUJ3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TCP11L1Q9NUJ3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TCP11L1Q9NUJ3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TCP11L1Q9NUJ3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TCP11L1Q9NUJ3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TCP11L1Q9NUJ3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TCP11L1Q9NUJ3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TCP11L1Q9NUJ3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TCP11L1Q9NUJ3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TCP11L1Q9NUJ3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TCP11L1Q9NUJ3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TCP11L1Q9NUJ3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TCP11L1Q9NUJ3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TCP11L1Q9NUJ3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TCP11L1Q9NUJ3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TCP11L1Q9NUJ3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
TCP11L1Q9NUJ3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TCP11L1Q9NUJ3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TCP11L1Q9NUJ3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TCP11L1Q9NUJ3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TCP11L1Q9NUJ3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
TCP11L1Q9NUJ3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TCP11L1Q9NUJ3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TCP11L1Q9NUJ3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TCP11L1Q9NUJ3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TCP11L1Q9NUJ3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TCP11L1Q9NUJ3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TCP11L1Q9NUJ3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TCP11L1Q9NUJ3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TCP11L1Q9NUJ3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TCP11L1Q9NUJ3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TCP11L1Q9NUJ3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TCP11L1Q9NUJ3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TCP11L1Q9NUJ3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TCP11L1Q9NUJ3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TCP11L1Q9NUJ3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TCP11L1Q9NUJ3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TCP11L1Q9NUJ3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TCP11L1Q9NUJ3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TCP11L1Q9NUJ3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TCP11L1Q9NUJ3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TCP11L1Q9NUJ3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TCP11L1Q9NUJ3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TCP11L1Q9NUJ3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TCP11L1Q9NUJ3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TCP11L1Q9NUJ3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
TCP11L1Q9NUJ3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TCP11L1Q9NUJ3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TCP11L1Q9NUJ3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TCP11L1Q9NUJ3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TCP11L1Q9NUJ3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TCP11L1Q9NUJ3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TCP11L1Q9NUJ3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TCP11L1Q9NUJ3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TCP11L1Q9NUJ3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TCP11L1Q9NUJ3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TCP11L1Q9NUJ3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TCP11L1Q9NUJ3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TCP11L1Q9NUJ3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TCP11L1Q9NUJ3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TCP11L1Q9NUJ3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TCP11L1Q9NUJ3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TCP11L1Q9NUJ3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TCP11L1Q9NUJ3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TCP11L1Q9NUJ3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TCP11L1Q9NUJ3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TCP11L1Q9NUJ3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TCP11L1Q9NUJ3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TCP11L1Q9NUJ3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
TCP11L1Q9NUJ3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
TCP11L1Q9NUJ3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TCP11L1Q9NUJ3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TCP11L1Q9NUJ3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TCP11L1Q9NUJ3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TCP11L1Q9NUJ3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TCP11L1Q9NUJ3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TCP11L1Q9NUJ3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TCP11L1Q9NUJ3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TCP11L1Q9NUJ3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TCP11L1Q9NUJ3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TCP11L1Q9NUJ3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TCP11L1Q9NUJ3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TCP11L1Q9NUJ3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TCP11L1Q9NUJ3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TCP11L1Q9NUJ3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TCP11L1Q9NUJ3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms