Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS61

KCNIP2, Kv channel-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP2Q9NS61 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNIP2Q9NS61 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNIP2Q9NS61 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNIP2Q9NS61 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNIP2Q9NS61 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNIP2Q9NS61 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNIP2Q9NS61 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNIP2Q9NS61 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNIP2Q9NS61 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNIP2Q9NS61 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNIP2Q9NS61 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNIP2Q9NS61 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNIP2Q9NS61 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNIP2Q9NS61 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNIP2Q9NS61 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNIP2Q9NS61 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNIP2Q9NS61 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNIP2Q9NS61 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNIP2Q9NS61 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNIP2Q9NS61 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNIP2Q9NS61 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNIP2Q9NS61 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNIP2Q9NS61 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNIP2Q9NS61 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNIP2Q9NS61 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNIP2Q9NS61 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNIP2Q9NS61 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNIP2Q9NS61 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNIP2Q9NS61 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNIP2Q9NS61 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNIP2Q9NS61 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNIP2Q9NS61 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNIP2Q9NS61 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNIP2Q9NS61 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNIP2Q9NS61 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNIP2Q9NS61 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNIP2Q9NS61 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNIP2Q9NS61 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNIP2Q9NS61 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNIP2Q9NS61 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNIP2Q9NS61 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNIP2Q9NS61 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNIP2Q9NS61 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNIP2Q9NS61 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNIP2Q9NS61 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNIP2Q9NS61 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNIP2Q9NS61 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNIP2Q9NS61 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNIP2Q9NS61 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNIP2Q9NS61 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KCNIP2Q9NS61 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KCNIP2Q9NS61 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KCNIP2Q9NS61 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KCNIP2Q9NS61 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KCNIP2Q9NS61 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNIP2Q9NS61 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNIP2Q9NS61 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNIP2Q9NS61 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNIP2Q9NS61 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNIP2Q9NS61 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNIP2Q9NS61 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNIP2Q9NS61 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNIP2Q9NS61 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNIP2Q9NS61 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNIP2Q9NS61 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNIP2Q9NS61 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNIP2Q9NS61 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNIP2Q9NS61 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNIP2Q9NS61 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNIP2Q9NS61 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNIP2Q9NS61 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNIP2Q9NS61 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNIP2Q9NS61 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNIP2Q9NS61 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNIP2Q9NS61 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNIP2Q9NS61 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNIP2Q9NS61 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNIP2Q9NS61 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNIP2Q9NS61 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNIP2Q9NS61 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNIP2Q9NS61 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNIP2Q9NS61 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNIP2Q9NS61 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNIP2Q9NS61 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNIP2Q9NS61 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNIP2Q9NS61 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNIP2Q9NS61 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNIP2Q9NS61 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNIP2Q9NS61 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNIP2Q9NS61 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNIP2Q9NS61 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNIP2Q9NS61 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNIP2Q9NS61 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNIP2Q9NS61 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNIP2Q9NS61 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNIP2Q9NS61 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNIP2Q9NS61 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNIP2Q9NS61 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNIP2Q9NS61 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNIP2Q9NS61 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms