Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC2

KCNK9, Potassium channel subfamily K member 9, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK9Q9NPC2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNK9Q9NPC2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNK9Q9NPC2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNK9Q9NPC2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNK9Q9NPC2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNK9Q9NPC2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNK9Q9NPC2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNK9Q9NPC2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNK9Q9NPC2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNK9Q9NPC2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNK9Q9NPC2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNK9Q9NPC2 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNK9Q9NPC2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNK9Q9NPC2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNK9Q9NPC2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNK9Q9NPC2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNK9Q9NPC2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNK9Q9NPC2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KCNK9Q9NPC2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KCNK9Q9NPC2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KCNK9Q9NPC2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNK9Q9NPC2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNK9Q9NPC2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNK9Q9NPC2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNK9Q9NPC2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNK9Q9NPC2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNK9Q9NPC2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNK9Q9NPC2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNK9Q9NPC2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNK9Q9NPC2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNK9Q9NPC2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNK9Q9NPC2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNK9Q9NPC2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNK9Q9NPC2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNK9Q9NPC2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNK9Q9NPC2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNK9Q9NPC2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNK9Q9NPC2 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNK9Q9NPC2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNK9Q9NPC2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNK9Q9NPC2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNK9Q9NPC2 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNK9Q9NPC2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNK9Q9NPC2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNK9Q9NPC2 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNK9Q9NPC2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNK9Q9NPC2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNK9Q9NPC2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNK9Q9NPC2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNK9Q9NPC2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNK9Q9NPC2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNK9Q9NPC2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNK9Q9NPC2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNK9Q9NPC2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNK9Q9NPC2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNK9Q9NPC2 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNK9Q9NPC2 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNK9Q9NPC2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNK9Q9NPC2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNK9Q9NPC2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNK9Q9NPC2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNK9Q9NPC2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNK9Q9NPC2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNK9Q9NPC2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNK9Q9NPC2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNK9Q9NPC2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNK9Q9NPC2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNK9Q9NPC2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNK9Q9NPC2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNK9Q9NPC2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KCNK9Q9NPC2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
KCNK9Q9NPC2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KCNK9Q9NPC2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
KCNK9Q9NPC2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNK9Q9NPC2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNK9Q9NPC2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNK9Q9NPC2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNK9Q9NPC2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNK9Q9NPC2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNK9Q9NPC2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNK9Q9NPC2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNK9Q9NPC2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNK9Q9NPC2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNK9Q9NPC2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNK9Q9NPC2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNK9Q9NPC2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNK9Q9NPC2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNK9Q9NPC2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNK9Q9NPC2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNK9Q9NPC2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNK9Q9NPC2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNK9Q9NPC2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNK9Q9NPC2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNK9Q9NPC2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNK9Q9NPC2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNK9Q9NPC2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNK9Q9NPC2 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNK9Q9NPC2 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNK9Q9NPC2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNK9Q9NPC2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms