Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZB8

CPEB1, Cytoplasmic polyadenylation element-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEB1Q9BZB8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPEB1Q9BZB8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPEB1Q9BZB8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPEB1Q9BZB8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPEB1Q9BZB8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPEB1Q9BZB8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPEB1Q9BZB8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPEB1Q9BZB8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPEB1Q9BZB8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPEB1Q9BZB8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPEB1Q9BZB8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPEB1Q9BZB8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPEB1Q9BZB8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPEB1Q9BZB8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPEB1Q9BZB8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPEB1Q9BZB8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPEB1Q9BZB8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPEB1Q9BZB8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CPEB1Q9BZB8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPEB1Q9BZB8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPEB1Q9BZB8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPEB1Q9BZB8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPEB1Q9BZB8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPEB1Q9BZB8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPEB1Q9BZB8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPEB1Q9BZB8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPEB1Q9BZB8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CPEB1Q9BZB8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CPEB1Q9BZB8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CPEB1Q9BZB8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CPEB1Q9BZB8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CPEB1Q9BZB8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CPEB1Q9BZB8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CPEB1Q9BZB8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPEB1Q9BZB8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPEB1Q9BZB8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPEB1Q9BZB8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPEB1Q9BZB8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPEB1Q9BZB8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPEB1Q9BZB8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPEB1Q9BZB8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPEB1Q9BZB8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPEB1Q9BZB8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPEB1Q9BZB8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPEB1Q9BZB8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPEB1Q9BZB8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPEB1Q9BZB8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPEB1Q9BZB8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPEB1Q9BZB8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPEB1Q9BZB8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPEB1Q9BZB8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPEB1Q9BZB8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPEB1Q9BZB8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPEB1Q9BZB8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPEB1Q9BZB8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPEB1Q9BZB8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPEB1Q9BZB8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPEB1Q9BZB8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CPEB1Q9BZB8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPEB1Q9BZB8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CPEB1Q9BZB8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CPEB1Q9BZB8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPEB1Q9BZB8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPEB1Q9BZB8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPEB1Q9BZB8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPEB1Q9BZB8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPEB1Q9BZB8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPEB1Q9BZB8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPEB1Q9BZB8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPEB1Q9BZB8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPEB1Q9BZB8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CPEB1Q9BZB8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CPEB1Q9BZB8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPEB1Q9BZB8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPEB1Q9BZB8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPEB1Q9BZB8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPEB1Q9BZB8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPEB1Q9BZB8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPEB1Q9BZB8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPEB1Q9BZB8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPEB1Q9BZB8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CPEB1Q9BZB8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPEB1Q9BZB8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPEB1Q9BZB8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPEB1Q9BZB8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPEB1Q9BZB8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CPEB1Q9BZB8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPEB1Q9BZB8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPEB1Q9BZB8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPEB1Q9BZB8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPEB1Q9BZB8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CPEB1Q9BZB8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CPEB1Q9BZB8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CPEB1Q9BZB8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CPEB1Q9BZB8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CPEB1Q9BZB8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CPEB1Q9BZB8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CPEB1Q9BZB8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CPEB1Q9BZB8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPEB1Q9BZB8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms