Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL6

SRSF8, Serine/arginine-rich splicing factor 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF8Q9BRL6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRSF8Q9BRL6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRSF8Q9BRL6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRSF8Q9BRL6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SRSF8Q9BRL6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRSF8Q9BRL6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SRSF8Q9BRL6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRSF8Q9BRL6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRSF8Q9BRL6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRSF8Q9BRL6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF8Q9BRL6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF8Q9BRL6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF8Q9BRL6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF8Q9BRL6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF8Q9BRL6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF8Q9BRL6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF8Q9BRL6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF8Q9BRL6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF8Q9BRL6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF8Q9BRL6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF8Q9BRL6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF8Q9BRL6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF8Q9BRL6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF8Q9BRL6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF8Q9BRL6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF8Q9BRL6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF8Q9BRL6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF8Q9BRL6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF8Q9BRL6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF8Q9BRL6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF8Q9BRL6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF8Q9BRL6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF8Q9BRL6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF8Q9BRL6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF8Q9BRL6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF8Q9BRL6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF8Q9BRL6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF8Q9BRL6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF8Q9BRL6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF8Q9BRL6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF8Q9BRL6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRSF8Q9BRL6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRSF8Q9BRL6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRSF8Q9BRL6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SRSF8Q9BRL6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SRSF8Q9BRL6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SRSF8Q9BRL6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SRSF8Q9BRL6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF8Q9BRL6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF8Q9BRL6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF8Q9BRL6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF8Q9BRL6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF8Q9BRL6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF8Q9BRL6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF8Q9BRL6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF8Q9BRL6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF8Q9BRL6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF8Q9BRL6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF8Q9BRL6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF8Q9BRL6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF8Q9BRL6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF8Q9BRL6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF8Q9BRL6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF8Q9BRL6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF8Q9BRL6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF8Q9BRL6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF8Q9BRL6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF8Q9BRL6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF8Q9BRL6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRSF8Q9BRL6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRSF8Q9BRL6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRSF8Q9BRL6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRSF8Q9BRL6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRSF8Q9BRL6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRSF8Q9BRL6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRSF8Q9BRL6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRSF8Q9BRL6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SRSF8Q9BRL6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRSF8Q9BRL6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRSF8Q9BRL6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRSF8Q9BRL6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRSF8Q9BRL6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRSF8Q9BRL6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRSF8Q9BRL6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRSF8Q9BRL6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRSF8Q9BRL6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRSF8Q9BRL6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRSF8Q9BRL6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRSF8Q9BRL6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRSF8Q9BRL6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRSF8Q9BRL6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRSF8Q9BRL6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRSF8Q9BRL6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SRSF8Q9BRL6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRSF8Q9BRL6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRSF8Q9BRL6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRSF8Q9BRL6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRSF8Q9BRL6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRSF8Q9BRL6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRSF8Q9BRL6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms